Mensen kunnen allergisch zijn voor avocado's. Dat geldt voor sommige personen die allergisch zijn voor berkenpollen. Ze kunnen symptomen vertonen zoals jeuk en ontsteking in mond en keel, meteen nadat ze avocado aten, of tot een uur daarna.
Ook mensen die allergisch zijn voor rubber reageren soms slecht op avocado's: ze hebben het zogenaamde latex-fruit syndroom. Sommigen van hen krijgen er netelroos door, buikpijn en braakneigingen. Een klein aantal mensen wordt er zelfs zo ziek van dat ze kunnen sterven. Maar dat is gelukkig een zeldzaam fenomeen. Minder dan één procent van de mensen is allergisch voor rubber, en van hen lijdt naar schatting 21 à 59 procent aan latex-fruit allergie.